新疆一枝蒿（Artemisia rupestris L.）是维吾尔医常用药材，具有抗炎、抗病毒等明确的药理活性。近年来新疆一枝蒿的野生资源匮乏，人工栽培品种受到重视与关注，并逐渐被临床所采用。由于不同的生长条件或生态因素对药用植物中代谢物的整体成分产生扰动，进而影响其药理活性。因此，针对不同品种的新疆一枝蒿中化学成分进行全面分析是十分必要的。采用代谢组学与转录组学整合的研究策略开展了新疆一枝蒿的人工栽培与野生品种的分子差异研究。该研究获取了新疆一枝蒿不同品种的花、茎、枝叶部位的代谢组和转录组差异；筛选出34个品种相关化学标志物，包括黄酮类和苯丙素类化合物，其中19个为潜在新化合物；结合相关性分析和qPCR，验证了与24个化学标志物密切相关的6个差异表达基因。该研究结果为新疆一枝蒿植物的质量控制提供了新的分子基础，并为药用植物学研究提供新的方法与视角。该研究成果发表于农林科学类1区Top类期刊Industrial crops & products, 2021,170：113732。